北京某大学附属精神病学医院医学中心高性能计算集群项目
生命科学项目
项目背景
该医院是国家卫健委委属的唯一一家精神专科医院,是世界卫生组织北京精神卫生研究和培训协作中心,也是中国疾病预防控制中心的精神卫生中心。医院围绕事关广大人民群众精神健康的全局性、关键性的重大医学问题,在精神卫生领域疑难危重症诊断与治疗、高层次人才培养、高水平基础医学研究与临床研究成果转化、解决重大公共卫生问题、医院管理等方面发挥牵头作用,引领全国精神医学技术发展方向。
客户需求
- 精神心理疾病是目前我国面临的严重公共卫生难题,具有就诊率低、治疗有效性低、致残率高等特点,给患者、家庭和社会带来沉重负担。该医院计划建立国家级精神疾病诊疗技术研发平台,有效存储、管理、分析精神心理疾病临床诊疗和科学研究产生的大量数据,目前医院现有数据平台的存储和计算资源不足以支撑日益增长的大数据需求,需要进一步扩充与升级。
项目内容
- 在医院现有数据平台的基础上进一步升级计算、存储的软硬件资源,搭建高性能计算集群,保障基础软硬件平台的高效平稳运行,支撑多个国家级平台的大数据存储和分析。
- 集群硬件包括管理/登录节点、计算节点、GPU 节点、分布式存储、融合存储、存储后端交换机,集群计算软件采用CHESS支撑整个集群资源的调度、管理、监控、计费,协助用户安装、优化BCFtools、BEDtools、VCFtools、vcflib、PLINK、Sambamba、SAMtools、Picard、Tabix、Seqtk、EIGENSOFT、bgenix、FastQC、Impute、BWA、GATK4、CNVKit等生命科学领域应用。
项目亮点
- 该系统软硬件产品均为国产化品牌,兼容主流操作系统及生物领域应用软件
- 用一套集群、一个平台实现CPU和GPU异构计算资源的统一纳管、监控
客户收益
- 为医院集群提供高性能计算能力、存储能力、高速网络互联能力、高性能集群的统一监控、管理、调度能力
- 有效存储、管理、分析精神心理疾病临床诊疗和科学研究产生的大量数据资源,促进精神疾病的临床诊疗
- 集成多种生物信息应用软件,提升新旧数据平台的存储和计算能力,建成国家级精神疾病诊疗技术研发平台