北京某医院生殖医学中心高性能计算集群项目

生命科学项目

项目背景

该医院生殖医学中心是中国大陆第一例试管婴儿诞生地,集医、教、研为一体,是世界上诊疗规模最大、技术最全面的生殖健康研究中心,围绕生殖内分泌和不孕症疾病的临床诊疗及其临床应用型基础研究进行了大量系统的工作,是国内首批生殖医学临床培训基地。

客户需求

  • 用户新建集群的同时,还需要纳入单机运行的现有设备,希望将这些机器组建为HPC集群模式,通过调度系统统一分发、提交作业,实现集群计算资源的高效利用;用户以生物信息应用为主,主要是基于常用生物信息应用相关pipeline的程序运行,协助进行基因领域的数据分析与计算,对集群存储容量与吞吐、单机计算力、内存容量等均有性能要求。

项目内容

  • 该集群硬件方面,除现有计算服务器外,新增管理节点服务器及IO服务器,存储采用SAN存储+分布式存储软件的模式实现存储弹性可扩展及高性能。
  • 软件方面,集群采用Linux操作系统,由CHESS提供现有设备和新购设备的统一部署、管理、监控、调度和计费等功能,并优化、集成多种生物应用软件可视化模板。

项目亮点

  • 利旧设备与新购设备组建成一套超算集群,实现计算资源高效利用;
  • 满足用户的生物信息计算需求,解决生物类数据分析算力巨量化、分散化的短板

客户收益

  • 了解生信类应用的特点,结合用户需求进行设计,实现用户最优化集群建设方案;
  • 集群搭建满足用户对集群存储容量与吞吐、单机计算力、内存容量的要求;
  • 保证集群计算性能,提升计算效率,降低集群建设成本,增强科研实力。

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